Pada tahun 1928, Arthur Spiderwick menulis panduan lapangan tentang banyak peri yang dia temui. Setelah menyelesaikan Buku tersebut, dia menyembunyikannya karena takut pada Mulgarath, seorang ogre yang bisa berubah bentuk yang berencana menggunakan rahasia Buku tersebut untuk kejahatan.
Delapan puluh tahun kemudian, Helen Grace yang baru saja bercerai mewarisi dan pindah ke perkebunan Spiderwick yang ditinggalkan bersama anak-anaknya, putri Mallory, dan putra kembar Jared dan Simon. Jared marah dengan kepindahan tersebut dan lebih memilih tinggal bersama ayahnya, Richard Grace. Setelah menemukan lift makanan yang tersembunyi, Jared menemukan ruang kerja Arthur di mana dia menemukan Panduan Lapangan. Ketika Jared menjelaskan penemuan Kitab dan keberadaan makhluk gaib, keluarganya tidak mempercayainya.
Keesokan paginya, Jared bertemu dengan seorang brownies bernama Thimbletack, yang awalnya marah pada Jared karena telah membuka buku yang seharusnya dilindungi Thimbletack dari Mulgarath. Jared menenangkannya dengan biskuit dan madu, dan Thimbletack memberi Jared batu berlubang yang memungkinkan Jared melihat peri yang biasanya tidak terlihat dengan melihatnya. Thimbletack memberitahunya tentang lingkaran jamur pelindung yang mengelilingi rumah.
